Ele havia perdido sua identidade, mas flashes de um passado não muito distante forçaram as lembranças. Jason Bourne (Matt Damon) fazia parte de um jogo comandado pelo governo americano, e quando achou que poderia descansar de uma vez por todas ao lado de Marie (Franka Potente), na Índia, os dois foram descobertos por um agente com a intenção de incriminá-lo.
Como única opção, largaram suas vidas para trás e começaram a correr.
Baseado no romance de Robert Lundlum, “A Supremacia Bourne” é a continuação de “A Identidade Bourne”, filme exibido no Brasil em 2002, cujo ponto central era um assassino tentando recuperar a memória enquanto fugia de seu passado.
Diferente da primeira parte, no novo filme Bourne não apenas foge do passado, mas principalmente tem um objetivo: se inocentar do crime que não cometera e se ver livre dessa matança em série (principalmente depois que o tal agente mata a sua namorada).
Um dos principais desafios da continuação, no entanto, era exatamente acertar a seqüência do filme, uma vez que na primeira parte Jason e Marie foram largados numa vila da Grécia, com ela alugando scooters
O filme todo faz sentido e segue em ritmo acelerado. As perseguições e as lutas são dignas, inclusive Matt Damon disse que foram reais para não ter o aspecto de kung fu voador.